Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms