Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2afjQ8R1M2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2afjQ8R1M2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2afjQ8R1M2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2afjQ8R1M2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2afjQ8R1M2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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