Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcsapQ8QZT2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms