Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms