Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PolbQ8K409 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms