Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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