Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casc3Q8K3W3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms