Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Vmn1r188Q8K3N2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r188Q8K3N2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r188Q8K3N2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r188Q8K3N2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r188Q8K3N2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r188Q8K3N2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Vmn1r188Q8K3N2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Vmn1r188Q8K3N2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Vmn1r188Q8K3N2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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