Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrtm1Q8K377 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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