Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sash3Q8K352 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sash3Q8K352 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms