Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms