Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms