Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs1Q8K212 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms