Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Glis1Q8K1M4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Glis1Q8K1M4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms