Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1L2

Spin4, Spindlin-4, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin4Q8K1L2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spin4Q8K1L2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spin4Q8K1L2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms