Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms