Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c1Q8K193 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms