Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FgbQ8K0E8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FgbQ8K0E8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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FgbQ8K0E8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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FgbQ8K0E8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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FgbQ8K0E8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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FgbQ8K0E8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FgbQ8K0E8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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