Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms