Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms