Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip10Q8CJ53 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms