Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cdkl1Q8CEQ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkl1Q8CEQ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cdkl1Q8CEQ0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cdkl1Q8CEQ0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cdkl1Q8CEQ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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