Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
9030612E09RikQ8CE20 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
9030612E09RikQ8CE20 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
9030612E09RikQ8CE20 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
9030612E09RikQ8CE20 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
9030612E09RikQ8CE20 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms