Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc17Q8CE13 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms