Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms