Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms