Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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