Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms