Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fbxo48Q8CAT8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms