Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms