Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms