Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sfrp1Q8C4U3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp1Q8C4U3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms