Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3W1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8C3W1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8C3W1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms