Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh12Q8BYK4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms