Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a2Q8BY89 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms