Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn17Q8BXA6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn17Q8BXA6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn17Q8BXA6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn17Q8BXA6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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