Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ6

UPF0505 protein C16orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BWQ6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BWQ6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BWQ6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms