Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cxcl16Q8BSU2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cxcl16Q8BSU2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cxcl16Q8BSU2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cxcl16Q8BSU2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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