Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU4

Clec9a, C-type lectin domain family 9 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec9aQ8BRU4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clec9aQ8BRU4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clec9aQ8BRU4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms