Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gga3Q8BMI3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms