Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf18Q8BM39 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prpf18Q8BM39 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prpf18Q8BM39 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf18Q8BM39 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf18Q8BM39 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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