Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp54Q8BL06 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms