Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms