Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf144bQ8BKD6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144bQ8BKD6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf144bQ8BKD6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf144bQ8BKD6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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