Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms