Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Atg4dQ8BGV9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4dQ8BGV9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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