Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms