Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M10.3Q85ZW6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.3Q85ZW6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms