Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc50Q810U5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc50Q810U5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms