Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NanogQ80Z64 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NanogQ80Z64 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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